Noeud 9: Nantes Omique - Phenics

Phenics évalue la qualité des matériaux constituant les plantes, en particulier les semences. L'installation a développé des approches et des outils pour analyser la structure interne des semences par imagerie multi spectrale, ainsi que le chemotypage des biopolymères tels que l'amidon, les protéines et les polysaccharides de paroi cellulaire et α-galactosides. Le phénotypage structural, basé sur l’imagerie multispectrale, est appliquée aux grains de blé, orge, maïs, pois et riz. Le phenotypage chimique est appliqué à diverses substrats d’origine végétale tels que les fruits, les légumes, les légumineuses, les céréales, les algues, les feuilles, les graines, les tige.Les débits d’analyses sont de 300 génotypes par jour pour le phénotypage structural et de 1000 génotypes par an pour le chemotypage. Phenics est également une composante de la plate-forme BIBS de l'INRA de Nantes

Les services proposés comprennent la cartographie multispectrale des tissus végétaux et plus particulièrement des graines, l'analyse de l'impact de variables biologiques et environnementales sur la structure interne des graines, l'analyse compositionnelle et structurale des biopolymères (nature et quantité), le profilage enzymatique structurale des polysaccharides (pectines, hémicelluloses)

Les équipements comprennent un système d’imagerie multispectrale (UV, Visible et Infrarouge) MUWI®, un système d’imagerie proche infrarouge (1000 – 2500 nm) (Burgermetrics®, Specim®*), Un robot de phénotypage des grains de blé, deux extracteurs : ASE 350 (Thermo), un automate SwingXL (Chemspeed), deux systèmes de chromatographie en phase gazeuse dont un couplé à un spectromètre de masse (TRACE GC ULTRA et TRACE GC-ISQ, Thermo), Chromatographie échangeuse d’anions (HPAEC-PAD, Thermo), une Chromatographie liquide haute performance couplée à un détecteur à fluorescence et un détecteur évaporatif à diffusion de lumière (ACQUITY UPLC H-Class, Waters)

Contact

Phenotypage structural : Benoît JAILLAIS (Tel : +33 (0)2 40 67 50 85 / +33 (0)2 51 78 55 54)

Phenotypage chimique: Sophie Le-Gall (Tel : +33 (0)2 40 67 50 98)

Automate pour la préparation des échantillons: deux extracteurs et plateforme chimique.

Equipement pour l'analyse de composition et de structure des biopolymères (Chromatographic systems -TRACE-GC-ULTRA, Thermo; HPAEC-PAD, Thermo- and mass spectrometry).